Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP133Q8WUM0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NUP133Q8WUM0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP133Q8WUM0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms