Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEL6

TRPC4AP, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4APQ8TEL6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPC4APQ8TEL6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRPC4APQ8TEL6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC4APQ8TEL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms