Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VN1R17PQ8TDU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VN1R17PQ8TDU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VN1R17PQ8TDU5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms