Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HAVCR2Q8TDQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HAVCR2Q8TDQ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HAVCR2Q8TDQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1702.4 ms