Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP61Q8NHU2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP61Q8NHU2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CFAP61Q8NHU2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP61Q8NHU2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms