Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER1

TRPV1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV1Q8NER1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV1Q8NER1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV1Q8NER1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV1Q8NER1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV1Q8NER1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms