Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDPRQ8NCN5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDPRQ8NCN5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDPRQ8NCN5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms