Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C10orf53Q8N6V4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C10orf53Q8N6V4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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