Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDCL2Q8N4E4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PDCL2Q8N4E4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PDCL2Q8N4E4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDCL2Q8N4E4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms