Protein–RNA interactions for Protein: Q8N414

PGBD5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD5Q8N414 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD5Q8N414 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGBD5Q8N414 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGBD5Q8N414 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms