Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3X1

FNBP4, Formin-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNBP4Q8N3X1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
FNBP4Q8N3X1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
FNBP4Q8N3X1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FNBP4Q8N3X1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FNBP4Q8N3X1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms