Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
VPS8Q8N3P4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
VPS8Q8N3P4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
VPS8Q8N3P4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
VPS8Q8N3P4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
VPS8Q8N3P4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms