Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3A8

PARP8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP8Q8N3A8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PARP8Q8N3A8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PARP8Q8N3A8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PARP8Q8N3A8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms