Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA5B2Q8N398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA5B2Q8N398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms