Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFT20Q8IY31 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFT20Q8IY31 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFT20Q8IY31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms