Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSRB3Q8IXL7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSRB3Q8IXL7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MSRB3Q8IXL7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms