Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTN4Q8IWV2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTN4Q8IWV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CNTN4Q8IWV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CNTN4Q8IWV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms