Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC50Q8IVM0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC50Q8IVM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC50Q8IVM0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC50Q8IVM0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms