Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
VSIG1Q86XK7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VSIG1Q86XK7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSIG1Q86XK7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSIG1Q86XK7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms