Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DHFR2Q86XF0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DHFR2Q86XF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DHFR2Q86XF0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHFR2Q86XF0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHFR2Q86XF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DHFR2Q86XF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms