Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC6Q86X45 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LRRC6Q86X45 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC6Q86X45 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms