Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM46Q7Z4K8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM46Q7Z4K8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM46Q7Z4K8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms