Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4H9

FAM220A, Protein FAM220A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220AQ7Z4H9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM220AQ7Z4H9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAM220AQ7Z4H9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM220AQ7Z4H9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms