Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC29A4Q7RTT9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC29A4Q7RTT9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC29A4Q7RTT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms