Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHSY3Q70JA7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHSY3Q70JA7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHSY3Q70JA7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms