Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP34Q70CQ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP34Q70CQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP34Q70CQ2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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