Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM43BQ6ZT52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM43BQ6ZT52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM43BQ6ZT52 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM43BQ6ZT52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms