Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MRPL54Q6P161 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRPL54Q6P161 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRPL54Q6P161 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms