Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEPROQ6NW34 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEPROQ6NW34 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEPROQ6NW34 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms