Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HMBOX1Q6NT76 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HMBOX1Q6NT76 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMBOX1Q6NT76 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms