Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC8EQ6NSJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC8EQ6NSJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms