Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPN13Q6MZZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAPN13Q6MZZ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPN13Q6MZZ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms