Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAB12Q6IQ22 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB12Q6IQ22 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms