Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HIST2H2AA3Q6FI13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HIST2H2AA3Q6FI13 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIST2H2AA3Q6FI13 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms