Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIM68Q6AZZ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM68Q6AZZ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM68Q6AZZ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM68Q6AZZ1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms