Protein–RNA interactions for Protein: Q68D42

TMEM215, Transmembrane protein 215, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM215Q68D42 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM215Q68D42 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM215Q68D42 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM215Q68D42 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms