Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGAP9Q5VTM2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AGAP9Q5VTM2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP9Q5VTM2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP9Q5VTM2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms