Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRIF1Q5T3J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRIF1Q5T3J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms