Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CFAP70Q5T0N1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CFAP70Q5T0N1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CFAP70Q5T0N1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CFAP70Q5T0N1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CFAP70Q5T0N1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms