Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LDLRAP1Q5SW96 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LDLRAP1Q5SW96 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDLRAP1Q5SW96 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms