Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPANXN3Q5MJ09 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPANXN3Q5MJ09 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms