Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLC27A3Q5K4L6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SLC27A3Q5K4L6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SLC27A3Q5K4L6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SLC27A3Q5K4L6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SLC27A3Q5K4L6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
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