Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRMPD3Q5JV73 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRMPD3Q5JV73 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FRMPD3Q5JV73 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FRMPD3Q5JV73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms