Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR44Q5JSH3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR44Q5JSH3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
WDR44Q5JSH3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms