Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMPK2Q5EBM0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMPK2Q5EBM0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms