Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KLHL22Q53GT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL22Q53GT1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL22Q53GT1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms