Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TPRNQ4KMQ1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPRNQ4KMQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TPRNQ4KMQ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
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