Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC9C1Q4G0N8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC9C1Q4G0N8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC9C1Q4G0N8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms