Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC00303Q3SY05 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LINC00303Q3SY05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LINC00303Q3SY05 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LINC00303Q3SY05 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms