Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KRTAP21-2Q3LI59 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms